Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN9O95484 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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