Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRATO95237 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRATO95237 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRATO95237 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRATO95237 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRATO95237 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRATO95237 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRATO95237 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRATO95237 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRATO95237 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRATO95237 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRATO95237 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms