Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA10O75578 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms