Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
JRKO75564 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JRKO75564 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JRKO75564 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms