Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKAP2O75563 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms