Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM6BO15054 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6BO15054 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms