Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLGNO14967 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLGNO14967 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLGNO14967 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLGNO14967 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms