Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms