Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms