Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E9PBE3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms