Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PATL2C9JE40 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms