Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms