Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJA3Q9Y6H8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GJA3Q9Y6H8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms