Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms