Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX8Q9Y5X2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX8Q9Y5X2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX8Q9Y5X2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms