Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R6

DMRT1, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT1Q9Y5R6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DMRT1Q9Y5R6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DMRT1Q9Y5R6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DMRT1Q9Y5R6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms