Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms