Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNPO3Q9Y5L0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNPO3Q9Y5L0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNPO3Q9Y5L0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms