Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms