Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANGPTL3Q9Y5C1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANGPTL3Q9Y5C1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms