Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KNSTRNQ9Y448 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KNSTRNQ9Y448 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KNSTRNQ9Y448 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KNSTRNQ9Y448 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms