Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP3Q9Y446 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms