Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC4Q9Y296 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms