Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKBQ9Y259 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKBQ9Y259 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms