Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCE1Q9Y256 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCE1Q9Y256 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms