Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP22Q9UPT9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms