Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX6Q9UNH7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms