Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX12Q9UMY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX12Q9UMY4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms