Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP18Q9UMW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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