Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRIP2Q9ULQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRIP2Q9ULQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms