Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF490Q9ULM2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF490Q9ULM2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF490Q9ULM2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms