Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI1Q9ULC6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PADI1Q9ULC6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms