Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms