Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CRLS1Q9UJA2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRLS1Q9UJA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRLS1Q9UJA2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms