Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NUFIP1Q9UHK0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUFIP1Q9UHK0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms