Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EXTL2Q9UBQ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXTL2Q9UBQ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms