Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTRRQ9UBK8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRRQ9UBK8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRRQ9UBK8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms