Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00474Q9P2X8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00474Q9P2X8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00474Q9P2X8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms