Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNKQ9P0W0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFNKQ9P0W0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms