Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT2Q9NZN8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT2Q9NZN8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT2Q9NZN8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms