Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYOFQ9NZM1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYOFQ9NZM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms