Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP3Q9NV31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP3Q9NV31 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms