Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMBRD1Q9NUN5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBRD1Q9NUN5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBRD1Q9NUN5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms