Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC3Q9NUD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC3Q9NUD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC3Q9NUD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms