Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNTG1Q9NSN8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTG1Q9NSN8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTG1Q9NSN8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms