Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZNF275Q9NSD4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF275Q9NSD4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms