Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBQLN4Q9NRR5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBQLN4Q9NRR5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms