Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTPS2Q9NRF8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms