Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DUOX1Q9NRD9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DUOX1Q9NRD9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DUOX1Q9NRD9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DUOX1Q9NRD9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DUOX1Q9NRD9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DUOX1Q9NRD9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DUOX1Q9NRD9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DUOX1Q9NRD9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DUOX1Q9NRD9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms