Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
OTORQ9NRC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTORQ9NRC9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTORQ9NRC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms