Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFCQ9NRA1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFCQ9NRA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFCQ9NRA1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFCQ9NRA1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms